PyMOL

PyMOL é um sistema de visualização de estruturas moleculares tridimensionais. É um projeto de código aberto e "user-sponsored". Versões 0.xx compiladas podem ser baixadas livremente do site, porém, versões a partir de 1.xx precisam, ou ser compiladas pelo usuário, ou obtidas, gratuitamente ou não, via registro.

Você pode obtê-lo em:
http://pymol.sourceforge.net/

Com boa documentação disponível gratuitamente em:
http://www.pymolwiki.org/index.php/Main_Page

Por muitos anos, o programa PyMOL foi disponibilizado livremente e, inclusive, foi utilizado em trabalhos capa de revistas de alto impacto como Science, Nature e Structure. Entretanto, as novas versões não mais são e a DeLano Scientific justifica a mudança de comportamento com o seguinte:

"Having freely provided PyMOL executables to the world community for over five years, DeLano Scientific LLC nowadays insists upon reciprocity from those who rely upon our software compilation and maintenance services. We have learned through experience that idealism must be tempered by practicality: If we do not recruit sufficient resources, then we will not achieve our long-term goals…

So, going forward… "the source shall remain free, but our ongoing efforts cannot be."

In other words, PyMOL is still FREE if you do your own code compilation, maintenance, and support!"

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